《財政部、國家稅務總局關于進一步鼓勵軟件產(chǎn)業(yè)和集成電路產(chǎn)業(yè)發(fā)展企業(yè)所得稅政策的通知》（財稅〔2012〕27號）第三條規(guī)定，我國境內新辦的集成電路設計企業(yè)和符合條件的軟件企業(yè)，經(jīng)認定后，在2017年12月31日前自獲利年度起計算優(yōu)惠期，第一年至第二年免征企業(yè)所得稅，第三年至第五年按照25%的法定稅率減半征收企業(yè)所得稅，并享受至期滿為止。經(jīng)認定的軟件企業(yè)，自獲利年度起可以享受兩免三減半稅收優(yōu)惠。

　　最新下發(fā)的《國家稅務總局關于執(zhí)行軟件企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策有關問題的公告》（國家稅務總局公告2013年第43號）第一條規(guī)定，軟件企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策適用于經(jīng)認定并實行查賬征收方式的軟件企業(yè)。第三條對“獲利年度”作出了詳細規(guī)定，即軟件企業(yè)的獲利年度，指軟件企業(yè)開始生產(chǎn)經(jīng)營后，第一個應納稅所得額大于零的納稅年度，包括對企業(yè)所得稅實行核定征收方式的納稅年度。

　　該文件一出，引起很多爭議。很多人認為，原則上實行查賬征收方式的軟件企業(yè)才能自獲利年度起享受兩免三減半優(yōu)惠，但由于獲利年度指包括實行核定征收方式的納稅年度，而核定征收方式的納稅年度肯定是“應納稅所得額大于零的納稅年度”，因此，實行核定征收方式的軟件企業(yè)也可以從實行核定征收方式的納稅年度開始享受兩免三減半優(yōu)惠，即實行核定征收方式的軟件企業(yè)，也可以享受稅收優(yōu)惠。

　　眾所周知，實行核定征收方式的企業(yè)不能享受企業(yè)所得稅稅收優(yōu)惠，那么軟件企業(yè)是否是個特例？答案是否定的，這是對國家稅務總局公告2013年第43號的誤讀。

　　國家稅務總局辦公廳對國家稅務總局公告2013年第43號的解讀中提到，由于核定征收企業(yè)不能享受相關稅收優(yōu)惠，企業(yè)所得稅實行核定征收方式的年度，由于存在事實上的應納稅額，因此，視為企業(yè)獲利年度的開始，此時由于企業(yè)不是查賬征收企業(yè)，不能享受軟件企業(yè)優(yōu)惠。對于這種情況，5年減免稅的優(yōu)惠期起始應從核定征收的年度計算。因此，實行核定征收方式的軟件企業(yè)，不能享受稅收優(yōu)惠，但優(yōu)惠期自實行核定征收方式的納稅年度算起，待改為實行查賬征收方式后，按照剩余年度繼續(xù)享受稅收優(yōu)惠。

　　例如，某經(jīng)認定的軟件企業(yè)2012年實行核定征收，2013年改為查賬征收，那么該軟件企業(yè)的獲利年度為2012年，由于2012年實行核定征收，不能享受優(yōu)惠，但5年優(yōu)惠期應自2012年算起，其享受稅收優(yōu)惠的年度為2013年免征企業(yè)所得稅，2014年~2016年減半征收企業(yè)所得稅。